Les lombrics prélèvent des débris végétaux dans la litière, les enfouissent et s'en nourrissent. Ils brassent le sol et creusent des galeries qui permettent d'aérer le sol et de faciliter l'infiltration de l'eau de pluie.

Les taupes vivent dans des galeries souterraines qu'elles creusent à l'aide de leurs mains très puissantes. Elle se nourrissent de lombric et tout comme eux contribuent au brassage et à l'aération du sol.

Le sol contient un grande diversité de microorganismes (bactéries, champignon, eucaryotes unicellulaires) qui se nourrissent généralement de la matière organique morte.